2、一、政策核心调整自2026年起，原“购进时抵9%、领用时再加1%”的抵扣模式被废止，企业购进用于生产13%税率货物的农产品时，进项税额统一按9%扣除率计算。这一调整源于《2019年第39号公告》第二条未被列入延续清单，导致支撑1%加计扣除的依据失效，政策直接简化为全程单一扣除率。
3、二、购进环节抵扣规则企业需根据凭证类型分类处理进项税额：
4、一般纳税人专票或海关缴款书：直接按票面税额抵扣，无需额外计算。小规模纳税人3%征收率专票：按发票金额×9%计算抵扣（例如：发票金额100元，可抵扣9元）。农产品销售发票或收购发票：按买价×9%计算抵扣（例如：买价100元，可抵扣9元）。关键点：所有凭证均以9%为基准，不再区分购进与领用环节，彻底消除原政策中“领用时加计”的复杂性。三、申报表填写要求2026年增值税申报表附列资料（二）中，第8a栏“加计扣除农产品进项税额”虽保留，但仅作过渡期备用。纳税人不得填报1%加计扣除额，若误填会导致系统提示申报异常。这一调整确保政策执行与申报数据一致，避免企业因惯性操作引发风险。
5、四、政策影响分析对农产品深加工企业而言，政策简化后：
6、合规成本降低：无需跟踪领用环节的加计扣除，减少核算误差风险。税负变化：原1%加计扣除取消后，部分企业税负可能小幅上升，但政策统一性增强。操作便利性提升：全程单一扣除率与购进凭证直接关联，更符合现代税收管理逻辑。企业需及时调整财务系统与核算流程，确保2026年起按新规则申报抵扣，避免因政策理解偏差导致税务风险。
农产品加工企业增值税进项税额核定扣除需依据政策规定选择计算方法并履行管理义务，具体要点如下：
一、政策依据与适用范围根据《财政部国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的通知》（财税〔2012〕38号）及地方实施细则（如上海市国家税务局公告2012年第6号），政策主要针对农产品加工行业（如乳制品、酒类等），部分地区（如广东省2025年）会更新扣除标准。税务机关会下发《农产品增值税进项税额核定扣除标准汇总表》，企业需按核定标准执行。例如，上海市自2025年12月1日起，列入汇总表的企业需严格遵循核定标准。
投入产出法：公式为“当期农产品消耗量×平均买价×扣除率÷（1+扣除率）”。其中，消耗量通过“销售数量×单耗标准”确定。例如，光明乳业酸牛乳（蛋白质含量≥3.5%）的单耗为1.261（即每生产1单位产品需1.261单位牛奶），奶粉（全脂）单耗为7.969。企业需根据实际生产货物名称匹配单耗标准。成本法：直接使用“主营业务成本×耗用率”计算，耗用率由税务机关提前核定，适用于无法准确核算单耗的企业。参照法：未详细展开，但属于可选方法之一，通常适用于无明确单耗标准或成本数据的企业。三、管理要求与合规义务
兼营项目处理：自2026年1月1日起，根据《中华人民共和国增值税法实施条例》第二十三条，兼营应税、免税等项目的企业需按销售额或收入占比逐期计算不得抵扣的进项税额，并于次年1月纳税申报期内完成全年汇总清算，逾期将面临处罚。年度清算义务：企业需在每年1月对上一年度进项税额抵扣情况进行汇总清算，确保数据准确、方法合规。四、行业适用性与地区差异政策主要针对农产品加工行业，但不同地区可能细化标准。例如，广东省2025年仍沿用并更新扣除标准，企业需关注地方税务机关通知，及时调整计算依据。
企业应结合自身生产类型、耗用农产品种类及税务机关核定标准，选择合适的计算方法，并严格履行年度清算义务，以规避税务风险。
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